Protein–RNA interactions for Protein: O88987

Akap3, A-kinase anchor protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap3O88987 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap3O88987 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap3O88987 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap3O88987 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Akap3O88987 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Akap3O88987 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Akap3O88987 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Akap3O88987 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Akap3O88987 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Akap3O88987 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Akap3O88987 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Akap3O88987 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Akap3O88987 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Akap3O88987 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Akap3O88987 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Akap3O88987 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Akap3O88987 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Akap3O88987 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Akap3O88987 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Akap3O88987 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Akap3O88987 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Akap3O88987 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Akap3O88987 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Akap3O88987 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Akap3O88987 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akap3O88987 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Akap3O88987 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Akap3O88987 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Akap3O88987 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akap3O88987 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akap3O88987 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akap3O88987 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Akap3O88987 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akap3O88987 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Akap3O88987 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms