Protein–RNA interactions for Protein: O88573

Aff1, AF4/FMR2 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff1O88573 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aff1O88573 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Aff1O88573 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Aff1O88573 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Aff1O88573 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Aff1O88573 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aff1O88573 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aff1O88573 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Aff1O88573 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aff1O88573 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Aff1O88573 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Aff1O88573 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aff1O88573 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aff1O88573 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aff1O88573 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Aff1O88573 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Aff1O88573 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Aff1O88573 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Aff1O88573 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Aff1O88573 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Aff1O88573 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Aff1O88573 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Aff1O88573 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Aff1O88573 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aff1O88573 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Aff1O88573 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aff1O88573 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aff1O88573 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aff1O88573 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aff1O88573 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aff1O88573 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aff1O88573 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aff1O88573 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aff1O88573 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aff1O88573 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aff1O88573 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aff1O88573 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms