Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cfdp1O88271 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cfdp1O88271 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cfdp1O88271 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cfdp1O88271 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cfdp1O88271 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cfdp1O88271 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cfdp1O88271 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cfdp1O88271 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cfdp1O88271 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cfdp1O88271 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cfdp1O88271 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cfdp1O88271 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cfdp1O88271 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cfdp1O88271 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cfdp1O88271 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cfdp1O88271 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cfdp1O88271 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cfdp1O88271 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cfdp1O88271 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cfdp1O88271 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cfdp1O88271 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cfdp1O88271 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cfdp1O88271 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cfdp1O88271 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cfdp1O88271 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cfdp1O88271 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cfdp1O88271 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cfdp1O88271 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cfdp1O88271 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cfdp1O88271 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cfdp1O88271 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cfdp1O88271 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Cfdp1O88271 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cfdp1O88271 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cfdp1O88271 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cfdp1O88271 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cfdp1O88271 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cfdp1O88271 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cfdp1O88271 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cfdp1O88271 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cfdp1O88271 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cfdp1O88271 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfdp1O88271 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfdp1O88271 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cfdp1O88271 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cfdp1O88271 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cfdp1O88271 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cfdp1O88271 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms