Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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Hcn4O70507 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hcn4O70507 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hcn4O70507 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hcn4O70507 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hcn4O70507 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hcn4O70507 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hcn4O70507 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hcn4O70507 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hcn4O70507 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hcn4O70507 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hcn4O70507 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hcn4O70507 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hcn4O70507 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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Hcn4O70507 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hcn4O70507 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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Hcn4O70507 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hcn4O70507 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hcn4O70507 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hcn4O70507 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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Hcn4O70507 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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Hcn4O70507 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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Hcn4O70507 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hcn4O70507 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hcn4O70507 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hcn4O70507 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hcn4O70507 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hcn4O70507 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hcn4O70507 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hcn4O70507 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hcn4O70507 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hcn4O70507 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hcn4O70507 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hcn4O70507 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hcn4O70507 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms