Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtssO70370 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtssO70370 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CtssO70370 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtssO70370 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtssO70370 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtssO70370 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtssO70370 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtssO70370 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtssO70370 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CtssO70370 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CtssO70370 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CtssO70370 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtssO70370 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CtssO70370 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CtssO70370 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtssO70370 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtssO70370 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtssO70370 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtssO70370 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtssO70370 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtssO70370 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtssO70370 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtssO70370 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtssO70370 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtssO70370 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtssO70370 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtssO70370 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtssO70370 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtssO70370 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtssO70370 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtssO70370 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CtssO70370 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtssO70370 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtssO70370 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtssO70370 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtssO70370 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CtssO70370 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtssO70370 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CtssO70370 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CtssO70370 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CtssO70370 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtssO70370 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtssO70370 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtssO70370 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CtssO70370 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtssO70370 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtssO70370 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtssO70370 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtssO70370 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtssO70370 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtssO70370 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CtssO70370 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtssO70370 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtssO70370 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtssO70370 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtssO70370 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CtssO70370 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CtssO70370 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CtssO70370 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtssO70370 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtssO70370 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CtssO70370 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtssO70370 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtssO70370 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CtssO70370 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtssO70370 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtssO70370 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtssO70370 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtssO70370 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtssO70370 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtssO70370 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CtssO70370 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtssO70370 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtssO70370 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtssO70370 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtssO70370 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtssO70370 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtssO70370 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtssO70370 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtssO70370 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtssO70370 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtssO70370 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtssO70370 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtssO70370 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtssO70370 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtssO70370 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtssO70370 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtssO70370 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtssO70370 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CtssO70370 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtssO70370 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtssO70370 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtssO70370 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtssO70370 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CtssO70370 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtssO70370 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtssO70370 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtssO70370 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtssO70370 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms