Protein–RNA interactions for Protein: O70169

Prss39, Inactive serine protease 39, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss39O70169 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prss39O70169 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prss39O70169 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prss39O70169 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prss39O70169 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prss39O70169 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prss39O70169 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prss39O70169 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss39O70169 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss39O70169 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss39O70169 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss39O70169 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss39O70169 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss39O70169 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss39O70169 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prss39O70169 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss39O70169 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss39O70169 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prss39O70169 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss39O70169 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prss39O70169 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prss39O70169 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prss39O70169 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prss39O70169 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prss39O70169 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prss39O70169 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1267.3 ms