Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Top3aO70157 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top3aO70157 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top3aO70157 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top3aO70157 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Top3aO70157 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top3aO70157 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top3aO70157 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top3aO70157 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top3aO70157 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3aO70157 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3aO70157 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top3aO70157 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top3aO70157 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top3aO70157 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top3aO70157 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top3aO70157 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Top3aO70157 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top3aO70157 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top3aO70157 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Top3aO70157 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms