Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RngttO55236 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RngttO55236 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RngttO55236 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RngttO55236 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RngttO55236 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RngttO55236 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RngttO55236 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RngttO55236 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RngttO55236 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RngttO55236 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RngttO55236 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RngttO55236 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RngttO55236 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RngttO55236 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RngttO55236 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RngttO55236 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RngttO55236 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RngttO55236 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RngttO55236 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RngttO55236 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RngttO55236 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RngttO55236 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RngttO55236 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RngttO55236 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RngttO55236 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RngttO55236 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RngttO55236 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RngttO55236 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RngttO55236 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RngttO55236 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RngttO55236 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RngttO55236 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RngttO55236 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RngttO55236 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RngttO55236 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RngttO55236 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RngttO55236 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RngttO55236 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RngttO55236 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RngttO55236 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RngttO55236 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RngttO55236 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RngttO55236 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RngttO55236 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RngttO55236 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RngttO55236 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RngttO55236 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RngttO55236 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RngttO55236 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RngttO55236 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RngttO55236 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RngttO55236 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RngttO55236 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RngttO55236 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RngttO55236 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RngttO55236 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RngttO55236 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RngttO55236 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RngttO55236 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RngttO55236 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RngttO55236 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RngttO55236 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RngttO55236 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RngttO55236 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RngttO55236 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RngttO55236 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RngttO55236 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RngttO55236 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RngttO55236 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RngttO55236 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RngttO55236 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RngttO55236 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RngttO55236 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RngttO55236 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RngttO55236 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RngttO55236 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RngttO55236 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RngttO55236 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RngttO55236 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RngttO55236 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RngttO55236 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RngttO55236 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RngttO55236 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RngttO55236 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RngttO55236 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RngttO55236 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RngttO55236 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RngttO55236 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RngttO55236 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RngttO55236 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RngttO55236 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RngttO55236 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RngttO55236 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RngttO55236 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RngttO55236 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RngttO55236 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RngttO55236 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RngttO55236 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RngttO55236 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms