Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlx3O55144 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlx3O55144 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlx3O55144 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlx3O55144 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlx3O55144 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlx3O55144 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms