Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Eif6O55135 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Eif6O55135 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Eif6O55135 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Eif6O55135 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Eif6O55135 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Eif6O55135 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Eif6O55135 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Eif6O55135 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Eif6O55135 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Eif6O55135 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Eif6O55135 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Eif6O55135 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Eif6O55135 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Eif6O55135 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Eif6O55135 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Eif6O55135 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Eif6O55135 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Eif6O55135 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Eif6O55135 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Eif6O55135 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Eif6O55135 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Eif6O55135 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Eif6O55135 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Eif6O55135 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Eif6O55135 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Eif6O55135 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Eif6O55135 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Eif6O55135 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Eif6O55135 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Eif6O55135 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Eif6O55135 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Eif6O55135 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Eif6O55135 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Eif6O55135 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Eif6O55135 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Eif6O55135 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Eif6O55135 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Eif6O55135 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Eif6O55135 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Eif6O55135 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Eif6O55135 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Eif6O55135 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Eif6O55135 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Eif6O55135 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Eif6O55135 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Eif6O55135 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Eif6O55135 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Eif6O55135 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Eif6O55135 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Eif6O55135 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Eif6O55135 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Eif6O55135 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Eif6O55135 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Eif6O55135 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif6O55135 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif6O55135 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif6O55135 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Eif6O55135 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms