Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nipsnap1O55125 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nipsnap1O55125 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap1O55125 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap1O55125 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap1O55125 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms