Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptpn20O55082 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ptpn20O55082 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ptpn20O55082 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptpn20O55082 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptpn20O55082 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptpn20O55082 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptpn20O55082 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms