Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gjd2O54851 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gjd2O54851 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjd2O54851 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjd2O54851 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjd2O54851 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjd2O54851 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms