Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Atp10aO54827 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Atp10aO54827 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Atp10aO54827 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Atp10aO54827 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Atp10aO54827 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Atp10aO54827 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Atp10aO54827 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Atp10aO54827 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Atp10aO54827 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Atp10aO54827 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Atp10aO54827 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Atp10aO54827 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Atp10aO54827 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Atp10aO54827 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Atp10aO54827 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Atp10aO54827 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Atp10aO54827 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Atp10aO54827 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Atp10aO54827 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
Atp10aO54827 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Atp10aO54827 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Atp10aO54827 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Atp10aO54827 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Atp10aO54827 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Atp10aO54827 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Atp10aO54827 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Atp10aO54827 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Atp10aO54827 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Atp10aO54827 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Atp10aO54827 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Atp10aO54827 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Atp10aO54827 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Atp10aO54827 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Atp10aO54827 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Atp10aO54827 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Atp10aO54827 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Atp10aO54827 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Atp10aO54827 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Atp10aO54827 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Atp10aO54827 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Atp10aO54827 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Atp10aO54827 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Atp10aO54827 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Atp10aO54827 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Atp10aO54827 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Atp10aO54827 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Atp10aO54827 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Atp10aO54827 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Atp10aO54827 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Atp10aO54827 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Atp10aO54827 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Atp10aO54827 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Atp10aO54827 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Atp10aO54827 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Atp10aO54827 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Atp10aO54827 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Atp10aO54827 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Atp10aO54827 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Atp10aO54827 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Atp10aO54827 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Atp10aO54827 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Atp10aO54827 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Atp10aO54827 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Atp10aO54827 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Atp10aO54827 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Atp10aO54827 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Atp10aO54827 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Atp10aO54827 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Atp10aO54827 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Atp10aO54827 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Atp10aO54827 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Atp10aO54827 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Atp10aO54827 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Atp10aO54827 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Atp10aO54827 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Atp10aO54827 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Atp10aO54827 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Atp10aO54827 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Atp10aO54827 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Atp10aO54827 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Atp10aO54827 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Atp10aO54827 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Atp10aO54827 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Atp10aO54827 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms