Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CaluO35887 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CaluO35887 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CaluO35887 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CaluO35887 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CaluO35887 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CaluO35887 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CaluO35887 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CaluO35887 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CaluO35887 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CaluO35887 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CaluO35887 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CaluO35887 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CaluO35887 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CaluO35887 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CaluO35887 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CaluO35887 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CaluO35887 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CaluO35887 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CaluO35887 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CaluO35887 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CaluO35887 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CaluO35887 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CaluO35887 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CaluO35887 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CaluO35887 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CaluO35887 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CaluO35887 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CaluO35887 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CaluO35887 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CaluO35887 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CaluO35887 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CaluO35887 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CaluO35887 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CaluO35887 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CaluO35887 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CaluO35887 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CaluO35887 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CaluO35887 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CaluO35887 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CaluO35887 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CaluO35887 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CaluO35887 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CaluO35887 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CaluO35887 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CaluO35887 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CaluO35887 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CaluO35887 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CaluO35887 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CaluO35887 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CaluO35887 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CaluO35887 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CaluO35887 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CaluO35887 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CaluO35887 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CaluO35887 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CaluO35887 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CaluO35887 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CaluO35887 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CaluO35887 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CaluO35887 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CaluO35887 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CaluO35887 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CaluO35887 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CaluO35887 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CaluO35887 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CaluO35887 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CaluO35887 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CaluO35887 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CaluO35887 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CaluO35887 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CaluO35887 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CaluO35887 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CaluO35887 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CaluO35887 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CaluO35887 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CaluO35887 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CaluO35887 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CaluO35887 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CaluO35887 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CaluO35887 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CaluO35887 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CaluO35887 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CaluO35887 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CaluO35887 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CaluO35887 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CaluO35887 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CaluO35887 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CaluO35887 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CaluO35887 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CaluO35887 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CaluO35887 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CaluO35887 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CaluO35887 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CaluO35887 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CaluO35887 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CaluO35887 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CaluO35887 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CaluO35887 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CaluO35887 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.7 ms