Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk4O35493 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk4O35493 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clk4O35493 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk4O35493 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk4O35493 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk4O35493 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clk4O35493 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clk4O35493 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clk4O35493 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clk4O35493 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clk4O35493 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk4O35493 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clk4O35493 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clk4O35493 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clk4O35493 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk4O35493 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clk4O35493 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clk4O35493 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clk4O35493 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms