Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Foxd2O35392 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxd2O35392 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxd2O35392 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Foxd2O35392 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxd2O35392 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Foxd2O35392 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms