Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dgcr6O35347 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dgcr6O35347 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dgcr6O35347 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dgcr6O35347 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dgcr6O35347 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dgcr6O35347 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dgcr6O35347 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dgcr6O35347 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dgcr6O35347 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dgcr6O35347 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dgcr6O35347 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dgcr6O35347 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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