Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenpaO35216 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CenpaO35216 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpaO35216 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CenpaO35216 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CenpaO35216 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CenpaO35216 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CenpaO35216 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpaO35216 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CenpaO35216 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.2 ms