Protein–RNA interactions for Protein: O35126

Atn1, Atrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atn1O35126 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atn1O35126 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atn1O35126 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atn1O35126 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atn1O35126 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atn1O35126 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atn1O35126 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atn1O35126 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atn1O35126 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atn1O35126 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atn1O35126 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atn1O35126 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atn1O35126 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atn1O35126 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atn1O35126 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atn1O35126 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atn1O35126 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atn1O35126 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atn1O35126 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atn1O35126 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atn1O35126 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atn1O35126 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atn1O35126 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atn1O35126 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atn1O35126 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atn1O35126 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atn1O35126 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atn1O35126 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atn1O35126 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atn1O35126 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atn1O35126 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atn1O35126 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms