Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scarb2O35114 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scarb2O35114 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarb2O35114 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarb2O35114 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scarb2O35114 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scarb2O35114 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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