Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ncoa3O09000 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Ncoa3O09000 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Ncoa3O09000 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ncoa3O09000 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ncoa3O09000 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Ncoa3O09000 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ncoa3O09000 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ncoa3O09000 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ncoa3O09000 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Ncoa3O09000 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncoa3O09000 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ncoa3O09000 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ncoa3O09000 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ncoa3O09000 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ncoa3O09000 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ncoa3O09000 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ncoa3O09000 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ncoa3O09000 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ncoa3O09000 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ncoa3O09000 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ncoa3O09000 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ncoa3O09000 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms