Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PrkcshO08795 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PrkcshO08795 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PrkcshO08795 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrkcshO08795 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PrkcshO08795 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PrkcshO08795 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PrkcshO08795 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PrkcshO08795 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrkcshO08795 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrkcshO08795 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PrkcshO08795 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PrkcshO08795 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PrkcshO08795 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PrkcshO08795 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PrkcshO08795 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PrkcshO08795 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrkcshO08795 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrkcshO08795 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
PrkcshO08795 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrkcshO08795 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrkcshO08795 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PrkcshO08795 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PrkcshO08795 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PrkcshO08795 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrkcshO08795 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrkcshO08795 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrkcshO08795 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PrkcshO08795 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PrkcshO08795 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrkcshO08795 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrkcshO08795 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PrkcshO08795 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PrkcshO08795 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PrkcshO08795 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PrkcshO08795 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PrkcshO08795 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PrkcshO08795 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrkcshO08795 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrkcshO08795 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrkcshO08795 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrkcshO08795 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrkcshO08795 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PrkcshO08795 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PrkcshO08795 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PrkcshO08795 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrkcshO08795 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrkcshO08795 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrkcshO08795 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PrkcshO08795 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PrkcshO08795 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms