Protein–RNA interactions for Protein: O08586

Pten, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtenO08586 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtenO08586 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PtenO08586 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtenO08586 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtenO08586 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PtenO08586 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtenO08586 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PtenO08586 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PtenO08586 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtenO08586 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtenO08586 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PtenO08586 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PtenO08586 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtenO08586 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtenO08586 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PtenO08586 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PtenO08586 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtenO08586 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtenO08586 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtenO08586 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtenO08586 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtenO08586 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtenO08586 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtenO08586 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtenO08586 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtenO08586 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtenO08586 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtenO08586 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtenO08586 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtenO08586 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtenO08586 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtenO08586 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtenO08586 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtenO08586 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtenO08586 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtenO08586 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtenO08586 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtenO08586 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtenO08586 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtenO08586 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtenO08586 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtenO08586 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtenO08586 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtenO08586 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtenO08586 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtenO08586 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtenO08586 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtenO08586 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtenO08586 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtenO08586 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtenO08586 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtenO08586 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtenO08586 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtenO08586 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtenO08586 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtenO08586 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtenO08586 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtenO08586 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtenO08586 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtenO08586 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PtenO08586 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtenO08586 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtenO08586 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtenO08586 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtenO08586 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtenO08586 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtenO08586 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtenO08586 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtenO08586 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtenO08586 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtenO08586 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtenO08586 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PtenO08586 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtenO08586 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PtenO08586 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtenO08586 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtenO08586 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtenO08586 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtenO08586 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtenO08586 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtenO08586 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtenO08586 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtenO08586 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtenO08586 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtenO08586 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtenO08586 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtenO08586 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtenO08586 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtenO08586 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtenO08586 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtenO08586 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtenO08586 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtenO08586 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtenO08586 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PtenO08586 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtenO08586 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtenO08586 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtenO08586 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtenO08586 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtenO08586 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms