Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IfnabL7MTU6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IfnabL7MTU6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IfnabL7MTU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
IfnabL7MTU6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IfnabL7MTU6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms