Protein–RNA interactions for Protein: K9J7H2

Gm4141, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4141K9J7H2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm4141K9J7H2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm4141K9J7H2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm4141K9J7H2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4141K9J7H2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4141K9J7H2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4141K9J7H2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm4141K9J7H2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm4141K9J7H2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm4141K9J7H2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm4141K9J7H2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm4141K9J7H2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm4141K9J7H2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm4141K9J7H2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm4141K9J7H2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm4141K9J7H2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4141K9J7H2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm4141K9J7H2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm4141K9J7H2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm4141K9J7H2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4141K9J7H2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4141K9J7H2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm4141K9J7H2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm4141K9J7H2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4141K9J7H2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4141K9J7H2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm4141K9J7H2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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