Protein–RNA interactions for Protein: K7N724

Gm3453, Predicted gene 3453, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3453K7N724 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3453K7N724 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm3453K7N724 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3453K7N724 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3453K7N724 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm3453K7N724 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3453K7N724 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3453K7N724 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3453K7N724 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3453K7N724 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3453K7N724 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3453K7N724 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3453K7N724 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3453K7N724 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3453K7N724 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3453K7N724 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms