Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2056J3QQ02 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm2056J3QQ02 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2056J3QQ02 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2056J3QQ02 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms