Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700122O11RikJ3QPW6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700122O11RikJ3QPW6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700122O11RikJ3QPW6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700122O11RikJ3QPW6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms