Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sclt1G5E861 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sclt1G5E861 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sclt1G5E861 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sclt1G5E861 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sclt1G5E861 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sclt1G5E861 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms