Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Arfgef1G3X9K3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Arfgef1G3X9K3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Arfgef1G3X9K3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Arfgef1G3X9K3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arfgef1G3X9K3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arfgef1G3X9K3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Arfgef1G3X9K3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Arfgef1G3X9K3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arfgef1G3X9K3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arfgef1G3X9K3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arfgef1G3X9K3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arfgef1G3X9K3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arfgef1G3X9K3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arfgef1G3X9K3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Arfgef1G3X9K3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Arfgef1G3X9K3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arfgef1G3X9K3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arfgef1G3X9K3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arfgef1G3X9K3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arfgef1G3X9K3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Arfgef1G3X9K3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arfgef1G3X9K3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arfgef1G3X9K3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms