Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
2210016F16RikG3X8U3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
2210016F16RikG3X8U3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
2210016F16RikG3X8U3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
2210016F16RikG3X8U3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
2210016F16RikG3X8U3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2210016F16RikG3X8U3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.7 ms