Protein–RNA interactions for Protein: G3UVW3

Slc38a6, Probable sodium-coupled neutral amino acid transporter 6, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a6G3UVW3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc38a6G3UVW3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a6G3UVW3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc38a6G3UVW3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc38a6G3UVW3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms