Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NpcdF8VQB8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NpcdF8VQB8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NpcdF8VQB8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NpcdF8VQB8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NpcdF8VQB8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NpcdF8VQB8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NpcdF8VQB8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NpcdF8VQB8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NpcdF8VQB8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NpcdF8VQB8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NpcdF8VQB8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NpcdF8VQB8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NpcdF8VQB8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NpcdF8VQB8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NpcdF8VQB8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NpcdF8VQB8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NpcdF8VQB8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NpcdF8VQB8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NpcdF8VQB8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NpcdF8VQB8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NpcdF8VQB8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NpcdF8VQB8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NpcdF8VQB8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NpcdF8VQB8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NpcdF8VQB8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NpcdF8VQB8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NpcdF8VQB8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NpcdF8VQB8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NpcdF8VQB8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms