Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGD5

Gm11020, Predicted gene 11020, mousemouse

Predictions only

Length 61 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11020F6ZGD5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11020F6ZGD5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11020F6ZGD5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11020F6ZGD5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11020F6ZGD5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm11020F6ZGD5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11020F6ZGD5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11020F6ZGD5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm11020F6ZGD5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11020F6ZGD5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm11020F6ZGD5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm11020F6ZGD5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm11020F6ZGD5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm11020F6ZGD5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms