Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2564F6Z9S8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2564F6Z9S8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2564F6Z9S8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2564F6Z9S8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2564F6Z9S8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2564F6Z9S8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2564F6Z9S8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2564F6Z9S8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2564F6Z9S8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2564F6Z9S8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2564F6Z9S8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2564F6Z9S8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2564F6Z9S8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2564F6Z9S8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms