Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5218F6YH22 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5218F6YH22 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5218F6YH22 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms