Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmod3E9QA62 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lmod3E9QA62 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmod3E9QA62 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmod3E9QA62 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Lmod3E9QA62 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod3E9QA62 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms