Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc7bE9Q9Y3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms