Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Arhgef5E9Q7D5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Arhgef5E9Q7D5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Arhgef5E9Q7D5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Arhgef5E9Q7D5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Arhgef5E9Q7D5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Arhgef5E9Q7D5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Arhgef5E9Q7D5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Arhgef5E9Q7D5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Arhgef5E9Q7D5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Arhgef5E9Q7D5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Arhgef5E9Q7D5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Arhgef5E9Q7D5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Arhgef5E9Q7D5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Arhgef5E9Q7D5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Arhgef5E9Q7D5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Arhgef5E9Q7D5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Arhgef5E9Q7D5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Arhgef5E9Q7D5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Arhgef5E9Q7D5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Arhgef5E9Q7D5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Arhgef5E9Q7D5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Arhgef5E9Q7D5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Arhgef5E9Q7D5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Arhgef5E9Q7D5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Arhgef5E9Q7D5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Arhgef5E9Q7D5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Arhgef5E9Q7D5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Arhgef5E9Q7D5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Arhgef5E9Q7D5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Arhgef5E9Q7D5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Arhgef5E9Q7D5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Arhgef5E9Q7D5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Arhgef5E9Q7D5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Arhgef5E9Q7D5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Arhgef5E9Q7D5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Arhgef5E9Q7D5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Arhgef5E9Q7D5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Arhgef5E9Q7D5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Arhgef5E9Q7D5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Arhgef5E9Q7D5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Arhgef5E9Q7D5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Arhgef5E9Q7D5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Arhgef5E9Q7D5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Arhgef5E9Q7D5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Arhgef5E9Q7D5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Arhgef5E9Q7D5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Arhgef5E9Q7D5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Arhgef5E9Q7D5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Arhgef5E9Q7D5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Arhgef5E9Q7D5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Arhgef5E9Q7D5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Arhgef5E9Q7D5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Arhgef5E9Q7D5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Arhgef5E9Q7D5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Arhgef5E9Q7D5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Arhgef5E9Q7D5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Arhgef5E9Q7D5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Arhgef5E9Q7D5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms