Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6S4

Gm17067, Predicted gene 17067, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17067E9Q6S4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17067E9Q6S4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17067E9Q6S4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17067E9Q6S4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17067E9Q6S4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm17067E9Q6S4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17067E9Q6S4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17067E9Q6S4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm17067E9Q6S4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17067E9Q6S4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm17067E9Q6S4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm17067E9Q6S4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17067E9Q6S4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm17067E9Q6S4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17067E9Q6S4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17067E9Q6S4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm17067E9Q6S4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm17067E9Q6S4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17067E9Q6S4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm17067E9Q6S4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm17067E9Q6S4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm17067E9Q6S4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm17067E9Q6S4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm17067E9Q6S4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm17067E9Q6S4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm17067E9Q6S4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms