Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trip11E9Q512 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trip11E9Q512 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trip11E9Q512 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trip11E9Q512 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trip11E9Q512 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trip11E9Q512 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trip11E9Q512 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trip11E9Q512 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip11E9Q512 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trip11E9Q512 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trip11E9Q512 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trip11E9Q512 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trip11E9Q512 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trip11E9Q512 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trip11E9Q512 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms