Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r56E9Q4U5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r56E9Q4U5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r56E9Q4U5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r56E9Q4U5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r56E9Q4U5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
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