Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpfE9Q3P4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpfE9Q3P4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpfE9Q3P4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpfE9Q3P4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpfE9Q3P4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpfE9Q3P4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CenpfE9Q3P4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CenpfE9Q3P4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CenpfE9Q3P4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CenpfE9Q3P4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CenpfE9Q3P4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CenpfE9Q3P4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CenpfE9Q3P4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpfE9Q3P4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms