Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap46E9Q2C0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap46E9Q2C0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap46E9Q2C0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap46E9Q2C0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap46E9Q2C0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap46E9Q2C0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap46E9Q2C0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap46E9Q2C0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap46E9Q2C0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cfap46E9Q2C0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfap46E9Q2C0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap46E9Q2C0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap46E9Q2C0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap46E9Q2C0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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