Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2A2

Gm38392, Predicted gene, 38392 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm38392E9Q2A2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm38392E9Q2A2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm38392E9Q2A2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm38392E9Q2A2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm38392E9Q2A2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm38392E9Q2A2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm38392E9Q2A2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm38392E9Q2A2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm38392E9Q2A2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm38392E9Q2A2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm38392E9Q2A2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm38392E9Q2A2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm38392E9Q2A2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm38392E9Q2A2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm38392E9Q2A2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm38392E9Q2A2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm38392E9Q2A2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm38392E9Q2A2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm38392E9Q2A2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm38392E9Q2A2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm38392E9Q2A2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm38392E9Q2A2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm38392E9Q2A2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm38392E9Q2A2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm38392E9Q2A2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm38392E9Q2A2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm38392E9Q2A2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm38392E9Q2A2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm38392E9Q2A2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm38392E9Q2A2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm38392E9Q2A2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm38392E9Q2A2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm38392E9Q2A2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm38392E9Q2A2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm38392E9Q2A2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm38392E9Q2A2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm38392E9Q2A2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm38392E9Q2A2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm38392E9Q2A2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm38392E9Q2A2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm38392E9Q2A2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm38392E9Q2A2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm38392E9Q2A2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm38392E9Q2A2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm38392E9Q2A2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm38392E9Q2A2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm38392E9Q2A2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm38392E9Q2A2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm38392E9Q2A2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm38392E9Q2A2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm38392E9Q2A2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm38392E9Q2A2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm38392E9Q2A2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms