Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430550D23RikE9Q1X6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
6430550D23RikE9Q1X6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
6430550D23RikE9Q1X6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
6430550D23RikE9Q1X6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430550D23RikE9Q1X6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430550D23RikE9Q1X6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms