Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NebE9Q1W3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
NebE9Q1W3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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