Protein–RNA interactions for Protein: E9Q048

Ermard, ER membrane-associated RNA degradation, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErmardE9Q048 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ErmardE9Q048 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ErmardE9Q048 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ErmardE9Q048 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ErmardE9Q048 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ErmardE9Q048 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ErmardE9Q048 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ErmardE9Q048 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ErmardE9Q048 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms