Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FgaE9PV24 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FgaE9PV24 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FgaE9PV24 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FgaE9PV24 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FgaE9PV24 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FgaE9PV24 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FgaE9PV24 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FgaE9PV24 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FgaE9PV24 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgaE9PV24 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgaE9PV24 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgaE9PV24 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FgaE9PV24 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FgaE9PV24 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FgaE9PV24 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FgaE9PV24 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms